MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	ATG	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019736	CAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308344
3	NC_019736	CAG	3	9	188	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308344
4	NC_019736	TG	4	8	226	233	0 %	50 %	50 %	0 %	428308344
5	NC_019736	AAC	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308345
6	NC_019736	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308345
7	NC_019736	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308345
8	NC_019736	TGG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308345
9	NC_019736	GT	3	6	714	719	0 %	50 %	50 %	0 %	428308345
10	NC_019736	CAAA	2	8	781	788	75 %	0 %	0 %	25 %	428308345
11	NC_019736	TAA	2	6	811	816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308345
12	NC_019736	ACT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
13	NC_019736	TGG	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308346
14	NC_019736	ACG	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
15	NC_019736	CTA	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308346
16	NC_019736	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
17	NC_019736	GTA	2	6	1000	1005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308346
18	NC_019736	TAA	2	6	1023	1028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308346
19	NC_019736	AGCTGA	2	12	1029	1040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428308346
20	NC_019736	AAAG	2	8	1065	1072	75 %	0 %	25 %	0 %	428308346
21	NC_019736	AC	3	6	1140	1145	50 %	0 %	0 %	50 %	428308346
22	NC_019736	ACA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308346
23	NC_019736	CAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308346
24	NC_019736	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308346
25	NC_019736	TAC	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019736	T	6	6	1370	1375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019736	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308347
28	NC_019736	GGT	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308347
29	NC_019736	GTT	2	6	1510	1515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308347
30	NC_019736	TATT	2	8	1523	1530	25 %	75 %	0 %	0 %	428308347
31	NC_019736	GAC	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308347
32	NC_019736	TACA	2	8	1575	1582	50 %	25 %	0 %	25 %	428308347
33	NC_019736	AT	3	6	1587	1592	50 %	50 %	0 %	0 %	428308347
34	NC_019736	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308347
35	NC_019736	TCG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308348
36	NC_019736	GTA	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308348
37	NC_019736	TGG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308348
38	NC_019736	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308348
39	NC_019736	CAG	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
40	NC_019736	CAC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308348
41	NC_019736	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308348
42	NC_019736	AAC	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308348
43	NC_019736	ATCA	2	8	1972	1979	50 %	25 %	0 %	25 %	428308348
44	NC_019736	CAG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308348
45	NC_019736	ATT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019736	CA	3	6	2353	2358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019736	AT	3	6	2372	2377	50 %	50 %	0 %	0 %	428308349
48	NC_019736	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
49	NC_019736	AAC	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
50	NC_019736	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
51	NC_019736	TCTA	2	8	2465	2472	25 %	50 %	0 %	25 %	428308349
52	NC_019736	TCAC	2	8	2482	2489	25 %	25 %	0 %	50 %	428308349
53	NC_019736	ACA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308349
54	NC_019736	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308349
55	NC_019736	ATTTT	2	10	2649	2658	20 %	80 %	0 %	0 %	428308349
56	NC_019736	TTA	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019736	TAG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019736	GTA	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019736	TAAT	2	8	2866	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019736	AAT	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019736	ATA	3	9	3047	3055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019736	TAC	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019736	GCA	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019736	TAGA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019736	ATA	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019736	TA	3	6	3143	3148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019736	CGAG	2	8	3156	3163	25 %	0 %	50 %	25 %	428308350
68	NC_019736	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
69	NC_019736	GAC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
70	NC_019736	AGA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308350
71	NC_019736	AGC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308350
72	NC_019736	GTT	2	6	3380	3385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308350
73	NC_019736	CCAG	2	8	3420	3427	25 %	0 %	25 %	50 %	428308350
74	NC_019736	TGA	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308350
75	NC_019736	GCG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308350
76	NC_019736	GCC	2	6	3532	3537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308350
77	NC_019736	A	6	6	3631	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	428308350
78	NC_019736	CAC	3	9	3692	3700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019736	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019736	ACA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019736	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019736	TGC	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019736	TAGT	2	8	4052	4059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019736	GAA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019736	TAG	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019736	AAT	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019736	TGC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019736	CTA	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019736	TCAACA	2	12	4212	4223	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019736	CTA	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019736	CGG	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019736	AGT	2	6	4320	4325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019736	ATTT	2	8	4354	4361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019736	TG	3	6	4419	4424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019736	GCA	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019736	CT	3	6	4522	4527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019736	GA	3	6	4533	4538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019736	ACC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019736	ACA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019736	AG	3	6	4694	4699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019736	GCC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019736	CTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019736	AATTTC	2	12	4950	4961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019736	CGG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019736	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019736	GTC	3	9	5227	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019736	ATG	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019736	TCC	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019736	CTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019736	T	8	8	5318	5325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019736	TGG	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019736	CCTTG	2	10	5400	5409	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_019736	ACT	2	6	5465	5470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019736	CCT	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019736	GCT	2	6	5526	5531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019736	GAC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019736	AGGA	2	8	5611	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019736	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
119	NC_019736	AGC	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
120	NC_019736	GCA	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
121	NC_019736	ACC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
122	NC_019736	GTA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308351
123	NC_019736	GACC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	428308351
124	NC_019736	CCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308351
125	NC_019736	CAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308351
126	NC_019736	TGC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308351
127	NC_019736	GCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
128	NC_019736	AAG	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308351
129	NC_019736	TAAT	2	8	6148	6155	50 %	50 %	0 %	0 %	428308351
130	NC_019736	GACGT	2	10	6181	6190	20 %	20 %	40 %	20 %	428308351
131	NC_019736	CAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308351
132	NC_019736	TAA	2	6	6349	6354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019736	CTA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019736	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019736	TGT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
136	NC_019736	GTA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308352
137	NC_019736	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308352
138	NC_019736	T	6	6	6640	6645	0 %	100 %	0 %	0 %	428308352
139	NC_019736	TGT	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308352
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272	NC_019736	CCT	2	6	12186	12191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_019736	GAC	2	6	12213	12218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_019736	ATA	2	6	12239	12244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019736	CTTCT	2	10	12255	12264	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
276	NC_019736	GTT	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308356
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283	NC_019736	AATA	2	8	12578	12585	75 %	25 %	0 %	0 %	428308356
284	NC_019736	CTGG	2	8	12592	12599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_019736	GATT	2	8	12638	12645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019736	TAT	2	6	12649	12654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308357
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304	NC_019736	TTAA	2	8	13291	13298	50 %	50 %	0 %	0 %	428308358
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327	NC_019736	AATC	2	8	14187	14194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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330	NC_019736	TA	3	6	14277	14282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_019736	TA	4	8	14289	14296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_019736	CTG	2	6	14409	14414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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372	NC_019736	GCA	2	6	16098	16103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
373	NC_019736	AG	3	6	16145	16150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
374	NC_019736	TGCAA	2	10	16181	16190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
375	NC_019736	A	6	6	16222	16227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
376	NC_019736	CAA	2	6	16233	16238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_019736	ACT	2	6	16307	16312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_019736	GA	3	6	16725	16730	50 %	0 %	50 %	0 %	428308361
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387	NC_019736	AG	3	6	17134	17139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
388	NC_019736	ATA	2	6	17146	17151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_019736	TTCT	2	8	17186	17193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
390	NC_019736	TCCAA	2	10	17218	17227	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
391	NC_019736	AGGT	2	8	17247	17254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
392	NC_019736	TAA	2	6	17265	17270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_019736	TGT	2	6	17390	17395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_019736	ATG	2	6	17496	17501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
399	NC_019736	TTG	2	6	17504	17509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
400	NC_019736	AG	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
401	NC_019736	GAA	2	6	17605	17610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_019736	GAA	2	6	17701	17706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308362
403	NC_019736	GTT	2	6	17794	17799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308362
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